加州大学圣地亚哥分校有七个通识教育学院:
Revelle College (罗杰·瑞弗尔学院)
John Muir College (登巴·缪尔学院)
Thurgood Marshall College (瑟古德·马歇尔学院)
Earl Warren College (厄尔·沃伦学院)
Eleanor Roosevelt College (埃莉诺·罗斯福学院)
Sixth College (第六学院)
Seventh College(第七学院)
六个学术型研究学部包括:
艺术人文学部(Art and Humanities)
生物科学学部(Biological Sciences)
物理科学学部(Physical Sciences)
社会科学学部(Social Sciences)
斯克利普斯海洋研究院(Scripps Institution of Oceanography)
Halıcıoğlu数据科学研究所(Halıcıoğlu Data Science Institute)
六个专业型研究学院包括:
赫伯特·韦特海姆公共卫生和人类长寿科学学院 (The Herbert Wertheim School of Public Health and Human Longevity Science)
雅各布斯工程学院(Jacobs School of Engineering)
雷迪管理学院(Rady School of Management)
全球政策与战略学院(School of Global Policy and Strategy)
斯卡格斯药剂学院(Skaggs School of Pharmacy & Pharmaceutical Sciences)
医学院(School of Medicine)